Чернівецький окружний адміністративний суд створений відповідно до Указу Президента України від 16 листопада 2004 року №1417/2004 «Про утворення місцевих та апеляційних адміністративних судів, затвердження їх мережі та кількісного складу суддів». 

В квітні 2008 року розпочалося створення суду, а 07 травня 2008 року Чернівецький окружний адміністративний суд було зареєстровано як юридичну особу в Єдиному державному реєстрі юридичних осіб та фізичних осіб-підприємців. 

З 02 березня 2009 року Чернівецький окружний адміністративний суд розпочав здійснювати судочинство. 

На початок своєї діяльності суддівський корпус суду складався з п’яти суддів. Станом на сьогоднішній день штатна чисельність суддів складає 12 осіб.